2 mars 2021 — Si les virus ont mauvaise presse en ce moment, c’est tout à fait normal, avec la coronavirus que l’on subit depuis un an. Pourtant tout n’est pas négatif, puisque cela a poussé les scientifiques à investiguer encore plus à l’intérieur de notre corps. Ces recherches ont permis de constituer un catalogue géant de 140 000 virus qui se cachent dans nos intestins.
Mais rassurez-vous, même si la moitié était totalement inconnue, ils sont souvent utiles au bon fonctionnement de nos intestins.
TOUS LES VIRUS NE SONT PAS NOCIFS
Si la découverte de dizaines de milliers de virus peut vous inquiéter, c’est tout à fait normal. Mais il ne faut pas se méprendre sur ce que représentent réellement ces micro-organismes. «Il est important de se rappeler que tous les virus ne sont pas nocifs, mais qu’ils font partie intégrante de l’écosystème intestinal», explique le biochimiste Alexander Almeida de l’Institut de bio-informatique du Laboratoire européen de biologie moléculaire. «Les échantillons contenant des virus inconnus provenaient principalement de personnes en bonne santé qui ne souffraient d’aucune maladie spécifique», a-t-il ajouté.
Le nouveau catalogue de virus , appelé la base de données sur les phages intestinaux (GPD), a été compilé en analysant plus de 28000 métagénomes individuels – des enregistrements de séquençage d’ADN accessibles au public d’échantillons de microbiome intestinal collectés dans 28 pays, ainsi que près de 2900 génomes de référence de bactéries intestinales cultivées .
Les résultats ont révélé 142 809 types de virus qui vivent dans l’intestin humain et appartiennent à un type spécial – les bactériophages. Ces virus infectent les bactéries ainsi que les organismes unicellulaires appelés archées.
UN ENVIRONNEMENT MYSTÉRIEUX
Dans l’environnement mystérieux du microbiome intestinal, on trouve une diversité d’organismes microscopiques, y compris des bactéries et des virus. Les bactériophages joueraient un rôle important dans la régulation du nombre de bactéries et affectant la santé de l’intestin humain lui-même.
«Les bactériophages … affectent profondément les communautés microbiennes en agissant comme des vecteurs de transfert de gènes, et en favorisant des interactions co-évolutives dynamiques», décrivent les chercheurs dans leur nouvel article.
Pendant longtemps, notre connaissance de ce phénomène était bloquée – peu de types de bactériophages étaient connus de la science. L’étude montre que plus d’un tiers des clusters de virus identifiés ne se limitent pas à infecter une espèce bactérienne, ce qui signifie qu’ils peuvent créer des réseaux de flux génique entre différents types de bactéries.
En outre, les chercheurs ont découvert 280 grappes de virus répartis dans le monde – parmi eux, des «communautés» virales bien connues et récemment découvertes, voire totalement inexplorées. Les scientifiques sont convaincus que les travaux futurs aideront à ouvrir encore plus le voile du secret sur la façon dont le monde complexe à l’intérieur de nos intestins fonctionne et comment même les habitants les plus insignifiants de celui-ci peuvent affecter la santé de tout l’organisme.
François Deymier (rédaction btlv.fr)
